诸君读者一又友们又碰头了约炮专区,今天给群众先容一款图片措置软件——ImageJ,这是一款免费的科学图像分析器具,等闲利用于生物学磋议限制。ImageJ软件大致对图像进行缩放、旋转、误解、暧昧等措置,也可策划采用区域内分析对象的一系列几何特征,包括长度、角度、周长、面积、长轴、短轴等等。更纰谬的是ImageJ的措置恶果受到多样杂志的等闲招供,不会出现作秀的问题。底下先容ImageJ的常勤勉能。
软件下载团结:
https://en.softonic.com/download/imagej/windows/post-download
软件下载解压后可径直使用,仍是先看一下ImageJ的界面,特别唐突明了,有多种图形和笔墨措置器具,可谓麻雀虽小五脏俱全。底下仍是例如阐明软件的常勤勉能。
1. 图像基本变换
橾在线观看单击菜单【File】→【Open】开放图像文献,以大兴机场图片(中间为原始图片)为例,对图像进行4种基本措置,操作如下:
a. 平滑措置:单击菜单【Process】→【Smooth】,单击菜单【File】→【Save As】领受图像时局(左);
b. 锐化措置:单击菜单【Process】→【Sharpen】,单击菜单【File】→【Save As】领受图像时局(右);
c. 蜕变图像类型:单击菜单【Image】→【Type】→领受图像类型(图中为8-bit)单击菜单【File】→【Save As】领受图像时局(上);
d. 颜色均衡:单击菜单【Image】→【Ajust】→【Color Balance】,单击菜单【File】→【Save As】领受图像时局(下)。
除了上述措置除外,ImageJ还能对图像进行旋转、缩放等操作,读者可逐一尝试约炮专区,在此不再赘述。
2. 细胞计数
ImageJ大致很通俗地纪录图片上的粒子个数,如细胞、病斑、孢子等等,底下以东说念主体红细胞图片为例阐明计数方法。
a. 蜕变图像方法,开放图片,单击菜单【Image】→【Type】→【8 bit】,将图片滚动成8位的灰度图;
b. 鼎新图片对比度,单击菜单【Image】→【Ajust】→【Brightness/Contrast】,将图片鼎新到稳健的对比度,这里用了Auto来自动鼎新;
c. (可选)若图片配景为玄色,则可单击菜单【Edit】→【Invert】,将图片变为白底;
d. 由于计数时只需要短长两种心情,单击菜单【Image】→【Ajust】→【Threthold】,用阈值算法将心情合并来鼎新,这里也用了Auto来自动鼎新;
e. 获取上述图片后,先要详情图片中粒子大小,这里小编先容一种毛糙目的,单击菜单【Analyze】→【Measure Panicles】,将粒子大小诞生为1进行预测算,获取平均粒子大小186.7,然后以这个数值算作粒子大小再行计数,就能获取相比准确的粒子数量了。
3. 条带灰度分析
ImageJ另外一个纰谬的功能是条带灰度值分析(DNA或Western Blot条带),底下西宾具体作念法。
a. 开放条带图片,单击菜单【Image】→【Type】→【8 bit】,将图片滚动成8位的灰度图;
b. 矩形器具领受要分析的条带,单击菜单【Analyze】→【Gels】→【Select First Lane】,选中后矩形框内会出现1的象征;
c. 单击菜单【Analyze】→【Gels】→【Plot Lanes】,获取开动峰图;
d. 用器具栏中的直线器具将峰图下方封口,使其成为几个独处的区域,用魔棒器具分辩点击这几个独处的区域,获取临了的灰度值统计恶果;
e. 测量多个条带的灰度值,可拖动图中的矩形框,选中下一滑条带,单击菜单【Analyze】→【Gels】→【Select Next Lane】,选中整个条带后,雷同使用直线器具封口,魔棒器具点击各区域获取面积,即灰度值;
f. 对数据作念归一化措置,这里由于16-20为对照,分辩用1-15每个条带的灰度值除以相应的对照,获取归一化的灰度值;
g. 临了在excel中整理数据,并在Prism中画出相应的柱状图。(对于Prism的使用,请参看科研论文作图之Graphpad Prism)
4. 图片导出
ImageJ的图片导出十分毛糙,单击菜单【File】→【Save As】,有Tiff, Gif, Png等多样常用的图片晌局,读者可左证需要自行领受。
好了,ImageJ的使用就给群众带来到这,另外给群众提供一个视频教程:
_video/Image-J-kuai-su-ru-men-ji-ji-ben-cao761484.html约炮专区